Semesterlön, semesteravdrag och semesterersättning vid ändrad sysselsättningsgrad

Har en anställd som gått ner från 100% till 80%. Månaden innan var hen föräldraledig alla dagar utom 2 som var semester. När jag tittar på lönespecen som genererats så baseras semesteravdraget och föräldradagarna på heltidslönen. Semesterlön och semestertillägg på en lägre sysselsättningsgrad. 
För mig verkar detta konstigt, ska inte allt vara på 100%, avvikelserna hänför sig ju till en månad med heltid. Nu känns det orättvist då endast avdragen går på den högre sysselsättningsgraden.

Någon som vet och kan hjälpa mig förstå och även förklara detta vidare till den anställde.