Hej @Linnéa E
Den information jag har är att frånvarorapporteringen till Skatteverket ska spegla de anställdas lönebesked vilket innebär att du som löneadministratör ska du rapportera det som du har gjort avdrag för på löneutbetalningen.
För att vara på den säkra sidan kan du slå en signal till supporten och om du får en annan lösning blir jag glad om du delar den med mig.
Välkommen att kontakta supporten