Med reservation för att jag är glad bokföringsamatör:
Jag tror det beror på om du använder faktureringsmetoden eller kontantmetoden.
Faktureringsmetoden: fakturan (och därmed intäkten) skall bokföras direkt och momsen skall därmed betalas in enligt vilken momsredovisningspoeriod man har. Det vill säga, du får inte vänta med att betala in momsen bara för att kunden inte betalar.
Kontantmetoden: fakturan bokförs när du får betalning. Därmed har inte vare sig intäkten eller momsen uppstått innan betalning - ANTAR jag! Har aldrig jobbar med kontantmetoden.
Grundläggande regel är att skatter, däribland moms, skall alltid in även om det finns tvister kring den. Betala först, klaga sedan. 🙂 Med det sagt, om man ansökt, och fått ok på, att redovisa sin moms i samband med årsdeklarationen så har man oftast lite tid på sig.
Hoppas detta och KjellP nedan hjälper dig en bit på vägen. Surt att gjort jobb som man inte får betalt för.